学院始建于1951年，其前身为青海省卫生学校。1993年经省教委评估，青海省卫生学校被省政府确定为“省部级重点中专学校”。2001年3月又被国家教育部确定为“国家级重点中等职业学校”。2003年4月经专家组评估，国家教育部批准在青海省卫生学校的基础上升格为“青海卫生职业技术学院”，属专科层次普通高等院校，同年正式招收普通高考学生，担负起全省医药类高职人才的培养任务，同年开始面向全国招生。2012年被省教育厅确定为“省级重点建设院校”。

韩福祥：2005.06.17-2012.04.13任青海卫生职业技术学院院长；袁宁：2012.04.13-2020.02.20任青海卫生职业技术学院院长.

截至2020年2月20日，学校官网显，学院现有在职教职工总数202人，其中专兼职教师154人，教授19人，副教授和高级讲师60人，副高以上职称教师占专兼职教师总数50%。师资队伍整体专业素质突出，“双师型”教师71人。

截至2020年2月20日，学校官网显示，学校开设护理、临床医学、药学、医学检验技术等16个专业。有省级重点专业4个，央财支持专业2个。院内现建有临床综合实训基地、护理综合实训基地、药学综合实训基地、医学检验综合实训基地等11个实训基地64个实验实训室，其中护理综合实验室和口腔实验室被原青海省卫生厅确定为省级重点实验室，护理综合实验室和临床综合实验室被青海省教育厅确定为省级实训基地。2014年5月14日由我院牵头组建了青海卫生职业教育集团，目前，已经发展成为一个拥有99家理事单位。

截至2020年2月20日，学校官网显，学院现有校园面积68亩，固定资产总值8205万元。现有5所（非直属）附属医院，4所教学医院，36家实习医院，18家实习基地（其中5家药企）。学院是“青海省乡村医生培训中心”、“ 青海省社区全科医生培训中心”、“青海省藏区卫生专业技术人员培训中心”和“青海省护理技能培训基地”等7个全省卫生人员培训基地以及青海省眼镜光配技能鉴定站。