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历史沿革：
1936年9月，国立药学专科学校（四年制）创校；是中国历史上第一所由国家创办的高等药学学府。
抗战时期，学校迁址汉口，复迁重庆；
1950年6月，学校更名为华东药学专科学校；
1952年11月，齐鲁大学药学系和东吴大学药学专修科并入，成立华东药学院；
1953年，武汉中南卫生专科学校药剂专科班并入；
1955年，学校开始招收研究生；
1956年6月，更名为南京药学院；
2001年，江苏省药科学校并入。 2011年，成为唯一入选教育部“卓越工程师教育培养计划”的医药院校。 [7] 2015年，南京鼓楼医院成为中国药科大学临床学院；南京市第一医院加盟中国药科大学，正式挂牌中国药科大学南京第一医院。 2017年，学校药理与毒理学、化学、临床医学3个学科领域的ESI排名进入全球前1%；药理与毒理学学科排名跨入全球前1‰。 2017年9月，入选国家首批“双一流”世界一流学科建设高校名单。 2018年3月，学校入选教育部首批国家级新工科研究与实践项目。 [11] 2018年10月，学校申报的“江苏省合成多肽药物发现与评价工程研究中心”获得江苏省发改委和教育厅建设立项；该中心是本批次全省药学领域唯一获准立项的工程研究中心，也是学校获得立项的首个工程研究中心。 [12] 2019年5月，由学校与杭州市钱塘新区携手共建的中国药科大学（杭州）创新药物研究院成立。

尹宗靖：1983.11至1986.10 任南京药学院院长，1986.10至1988.10任中国药科大学校长；徐群：1988.10-997.6任中国药科大学校长-；吴晓明：1997.6-2013.1任中国药科大学校长；来茂德：2013.1.29到至今任中国药科大学校长。
历任党委书记：
徐 群 南京医药学院党委书记 1983.11--1986.10
徐 群 南京医药学院党委书记 1986.10--1988.10
徐 群 南京医药学院党委书记 1991.12--1995.3
李干生 中国药科大学党委书记 1995.3--1997.6
吴晓明 中国药科大学党委副书记（主持党委工作）1997.6--2013.1
胡金波 中国药科大学党委书记 2001.11--2008.3
刘贵友 中国药科大学党委书记 2008.3--2011.11

截至2020年1月2日，学校官网显示，学校图书馆面积3.4万平方米，藏书总量约155万余册，可提供利用的中文电子期刊2万余种、外文电子期刊近4000种，已形成了以药学、化学书刊为主体，相关学科文献协调发展的多学科藏书体系。

截至2020年1月2日，学校官网显示，中国药科大学下辖14个院系（部），涵盖医学、理学、工学等7个学科门类，有29个本科专业、3个专科（高职）专业。

截至2020年1月2日，学校官网显示，中国药科大学有药学、中药学2个一级学科博士点，24个博士学位授权点，29个硕士学位授权点；设有药学、中药学2个博士后流动站，23个学科专业可招收博士后研究人员，药学一级学科为国家一级重点学科，覆盖6个二级国家重点学科；药理学、中西医结合为江苏省重点学科。