学校前身为青海工学院，始建于1958年。1960年11月，与青海农牧学院、青海医学院、青海财经学院合并为青海大学，“文革”初期被撤销。1971年恢复青海工农学院，设有工、农两大学科。1988年恢复青海大学。1997年10月，青海畜牧兽医学院并入青海大学。2001年1月，青海省农林科学院、青海省畜牧兽医科学院、青海财经职业学院整建制划归青海大学，2004 年青海医学院并入，组建成新的青海大学。2008年成为国家“211工程”重点建设大学，2012年入选全国14所“中西部高校提升综合实力”高校行列，2016年成为国家首批百所创新创业示范校，2017年入选国家“世界一流学科”建设高校，2018年成为教育部与青海省人民政府“部省合建”高校。

蒋焕东：1998.06-2002.4.25任青海大学校长；李建保：2002.04.25-2005.9任青海大学校长；陈强：2005.9-2009.10.20任青海大学校长；梁曦东：2009.10.20-2013.07.11任青海大学校长；王光谦：2013.07.11-2020.02.20任青海大学校长。

截至2020年2月20日，学校官网显，学校在校生27000余人，其中博士研究生145人、硕士研究生1898人、本科生21000余人。学校有教职工4615人，其中医护和专职科研人员 2565人、专任教师1467人，专任教师中有博士420余人，硕士以上学位人员占87%。

截至2020年2月20日，学校官网显示，学校现有世界一流建设学科1个、国家重点学科2个、省级重点学科16个，设有博士学位授权点5个，硕士学位授权点57个，硕士专业学位授权领域40个，本科专业69个，其中国家级特色专业6个；有国家级教学团队2个、国家级人才培养模式创新实验区1个、国家级实验教学示范中心1个、国家级大学生校外实践教育基地1个、国家级卓越计划项目9项、国家级专业综合改革项目1项、国家级精品视频公开课3门、国家级双语示范课1门；有国家重点实验室1个、国家重点实验室分室2个、国家地方联合工程实验室（研究中心）3个、教育部重点实验室3个、农业部实验室（中心）4个、国家林业局重点实验室1个、国育华渔VR世界实验室1个；国家大学科技园1个、国家级新农村发展研究院1个。

截至2020年2月20日，学校官网显， 学校坚持开放办学，不断加强对外交流与合作。在清华大学、西北农林科技大学、中国地质大学（北京）、华东理工大学等高校的大力支持下，学科专业、师资队伍、人才培养、科学研究等方面取得了长足的发展和进步。先后与美国、英国、澳大利亚、新西兰、日本、韩国、台湾等20多个国家和地区的高校签署了交流合作备忘录，开展务实合作。加入了“丝绸之路农业教育科技创新联盟”，入选“高等学校学科创新引智计划”，启动了新一轮清华大学—奥克兰大学—青海大学“三兄弟”模式合作项目，持续推进国际交流与合作。