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1958年，中共浙江省委决定创办一所高等林业院校，定名“天目林学院”。当年6月，以省林业厅为主，建德地委抽调党政干部，一批知名教授和留学归国学者共同参与筹建。当时确定专业设置为林业、木材采伐与运输机械化、木材机械加工和林产化学加工工艺专业。招生规模400名。1959年7月，省委、省人委决定，温州林学院与天目林学院合并。1960年2月，省委决定，浙江农学院、天目林学院、舟山水产学院合并，成立浙江农业大学。1962年2月，省委决定，天目林学院从浙江农业大学划出，归省教育厅领导，党委工作归省高校党委领导。原属省农科院领导的林科所划归省林业厅和天目林学院双重领导。1966年9月，省人民委员会同意“天目林学院”改名为“浙江林学院”。1970年7月，省革委会决定浙江林学院与浙江农业大学合并。1978年4月，省革委会决定，浙江农业大学林学系改为浙江农业大学天目分校。1979年2月，国务院批准同意恢复浙江林学院。设林学、林业特产专业，学生规模1000人。1981年12月，国务院批准浙江林学院为首批学士学位授予单位。1986年7月，根据省委、省政府指示，浙江林学院由省林业厅主管改由省教委主管。 1997年11月，顺利通过国家教委对我校本科教学合格评价。 2000年7月，浙江省林业干部学校整体并入浙江林学院。 2000年12月，浙江省发展计划委员会批复同意浙江林学院扩建。 2003年9月，国务院学位委员会正式批准该校为硕士学位授予单位。 2007年5月，以优秀成绩通过教育部本科教学工作水平评估。2010年3月，经教育部批准浙江林学院更名为浙江农林大学。 2013年1月，浙江农林大学申报的“竹资源与高效利用人才培养项目”被国务院学位委员会批准为服务国家特殊需求博士人才培养项目，可授予博士学位的学科为林学。 2014年，浙江省人民政府与国家林业局签订共建浙江农林大学协议。 2017年6月，浙江农林大学举行动物科技学院揭牌仪式。

王宪恩：1978.7-1984.2任浙江林学院院长； 戎文治：1984.7-1987.1任浙江林学院院长；刘茂春：1987.1-1990.10任浙江林学院院长； 忻士文：1990.10-1992.9； 田荆祥：1992.9-1998.8任浙江林学院院长； 方志刚1998.8-2000.7任浙江林学院院长； 张齐生：2000.7-2008.12任浙江农林大学校长； 周国模：2008.12-2017.04.14任浙江农林大学校长；应义斌：2017.04.14-2020.02.17任浙江农林大学校长。

截至2020年2月17日，学校官网显，学校现有教职工2230余人，其中专任教师近1300人，高级职称700余人。拥有中国工程院院士1人、共享院士5人、浙江省特级专家2人、国家教学名师1人、“长江学者”特聘教授2人、国家“杰出青年科学基金”获得者2人、国家“万人计划”领军人才1人、 “新世纪百千万人才工程”国家级人选5人，“长江学者”青年学者1人、中宣部“四个一批”人才1人、科技部创新领军人才1人。

截至2020年2月17日，学校官网显示，设有16个学院（部）和1个独立学院，64个本科专业，其中国家级特色专业4个，国家专业综合改革试点项目1个，国家新工科项目1个，国家卓越农林教育人才培养计划专业7个，省级重点专业12个，省级优势专业7个，省级特色（含新兴特色）专业9个；现有浙江省一流学科（A类）3个，浙江省一流学科(B类)9个，浙江省重点建设高校优势特色学科1个；国家林业和草原局重点学科与重点培育学科5个；ESI学科领域全球前1%学科4个。

截至2020年2月17日，学校官网显示，学校现有东湖、衣锦、诸暨3个校区，占地面积3200余亩，校舍建筑面积90余万平方米，仪器设备总值4.73亿元。