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温州医科大学是浙江省省属重点建设大学。学校可溯源至创办于1912年的浙江医学专门学校，1958年8月由浙江医学院从杭州分迁至温州建立，初名“浙江第二医学院”，后以校址所在地改名为“温州医学院”，2013年更名为“温州医科大学”。2013年，温州医科大学入选国家首批临床医学研究生培养模式改革试点高校，是浙江省首个“国家医师资格考试实践技能考试与考官培训基地”。

现任领导：
李日千：1988.7-1997.1任温州医学院院长；瞿佳：1997.3-2013.6任温州医学院院长；瞿佳：2013.6-2015.10任温州医科大学校长；吕帆：2015.10-2018.4任温州医科大学校长；李校堃：2018.4-2020.02.01任温州医科大学校长。

截至2020年2月1日，学校官网显示，进入全球前1%的学科数从2017年9月省重点高校启动建设前的3个增加到5个，学校ESI综合排名位列中国内地高校第74位，位列省委部共建医学院校高校第八位，位列浙江省省属高校第一位，全球排名升至第1237位。

截至2020年2月1日，学校官网显示，学学校有1个一级学科博士点，8个一级学科硕士点，6个专业硕士学位授权点，1个博士后科研流动站；有2个浙江省“重中之重一级学科”，3个浙江省A类一流学科、7个B类一流学科，10个浙江省高校重点学科。

截至2020年2月1日，学校官网显示，学校有1个国家工程技术研究中心，2个国家研究基地，1个国家重点实验室，13个省部级重点实验室（研究中心），1个省部共建国家重点实验室，1个省部共建教育部工程研究中心，1个省部共建教育部重点实验室，1个卫生部研究中心，1个卫生部重点实验室，2个浙江省工程技术研究中心，1个浙江省“2011协同创新中心”。