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谷亨杰 1987年6月26日任温州师范学院院长（1983年至1987年任温州师专校长）；李日增:1993.9.7-1997.5任温州师范学院院长;马大康：1997.6-2004.6任温州师范学院院长。蔡袁强：2008.3-2015.7任温州大学校长；李校堃：2015.8-201804任温州大学校长；赵敏：2018.9-2020.02.01任温州大学校长。

2004年3月27日 全国高等学校设置评议委员会在四川成都召开会议，表决通过温州师范学院与温州大学合并筹建新温州大学。 2004年4月5日 学校承办全国高等师范院校外语教学研究协作组2004年学术年会。 2004年5月 中国红蜻蜒集团捐资100万元，建立温州师范学院美术学院鞋靴科技创新基金会。 2004年5月14日至17日 学校承办第五届全国生物数学年会。 2004年5月19日 教育部办公厅教发厅函[2004] 23号文，同意在温州师范学院与温州大学合并的基础上筹建温州大学，筹建期为一年。 2004年5月20日 学校选送的四位学生在参加浙江省第四届大学生艺术声乐、器乐(专业组)专场比赛中获一、二等奖各1个，三等奖2个。 2004年5月，教育部同意在温州师范学院与温州大学合并的基础上筹建新的温州大学。

温州师范学院设有国际经济与贸易、社会工作、汉语言文学、英语、广告学、编辑出版学、艺术设计、动画、信息与计算科学、统计学、电子信息工程、通信工程、计算机科学与技术、环境工程、食品科学与工程、食品质量与安全、生物工程、信息管理与信息系统、工程管理、工商管理、市场营销、会计学、财务管理、人力资源管理、电子商务、行政管理、公共事业管理、劳动与社会保障等。学校现设有人文学院、法政学院、经济与管理学院、外国语学院、数学与信息科学学院、物理与电子信息学院、化学与材料科学学院、生命与环境科学学院、计算机科学与工程学院、美术学院、音乐学院、体育学院、教育科学学院、学前教育学院、初等教育学院、瓯江学院、成人教育学院、继续教育学院等18个二级学院，共有50多个本专科专业，6个硕士学位授予点。