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同济大学始于1900年前后，由德国海军随舰医生埃里希·宝隆创办的“同济医院”，1907年10月1日埃里希·宝隆创办上海德文医学堂。1927年08月，由南京国民政府教育部正式接管，命名为国立同济大学，原医、工两科分别更名为医学院、工学院。1995年10月，国家教委和上海市人民政府正式宣布共建同济大学。1996年07月，原上海建材工业学院和上海城建学院并入同济大学。2000年，原上海铁道大学与同济大学合并，同时成立新的同济大学医学院，2003年11月，原上海航空工业学校划归同济大学，2004年09月，嘉定校区启用，同济大学软件学院以及汽车学院首批入驻。2007年5月20日，同济大学迎来百年校庆。现有建筑与城市规划、土木工程、经济与管理、电子与信息工程、环境科学与工程、外国语、人文、法政、材料科学与工程、机械工程、医学、理学、交通运输、汽车、海洋与地球科学、生命科学与技术、航空航天与力学、传播与艺术、女子学院及软件学院等学院，还建有继续教育、高等技术、职业技术教育、国际文化交流、网络教育、汽车营销及电影学院等。2009年，入选国家“珠峰计划“。2010年6月，教育部和上海市宣布继续共建同济大学；入选教育部第一批“卓越工程师教育培养计划”高校。9月16日，教育部和国家海洋局在北京签署协议，合作共同推进17所高校涉海学科建设及科技创新平台建设，同济大学名列其中。同年，被教育部评为“全国毕业生就业典型经验高校”；获评“全国工程硕士研究生教育创新院校”。2011年11月，同济大学与中国气象局正式建立局校合作关系。12月，获得“全国文明单位”荣誉称号。2012年9月，首批入选国家级大学生创新创业训练计划项目。11月，入选教育部卫生部第一批卓越医生教育培养计划项目试点高校和国家首批卓越法律人才教育培养基地。2013年，主办21世纪学术联盟第6届总会。 2014年，入选国家“2011计划”。2016年11月，在联合国世界知识产权组织（WIPO）、中国国家知识产权局和上海市政府的支持下，同济大学在知识产权学院基础上，正式成立了“上海国际知识产权学院”。 2017年1月，被教育部认定为“全国首批深化创新创业教育改革示范高校”。5月，加入中英大学工程教育与研究联盟。7月，被教育部评为“全国创新创业典型经验高校“。9月，同济大学入选国家“双一流”（世界一流大学和一流学科）建设高校名单；首批加入中日人文交流大学联盟。 2018年5月，经国务院学位委员会批准，同济大学成为首批20所学位授权自主审核高校之一。6月，首批入选上海高等学校一流本科建设引领计划。 2019年4月，首批入选上海高等学校一流研究生教育引领计划。7月，首批入选中国高校行星科学联盟。

吴明舜：1990.06-1999.07任上海建材工业学院院长；乐卫松：1985.06-1996.05任上海航空工业学校校长；江景波：1984.4-1989.2；高廷耀：1989.2-1995.2；吴启迪：1995.2-2003.7；万钢：2003.7-2007.8任同济大学校长；裴钢：2007.8-2016.9任同济大学校长；钟志华：2016.9-2018.7任同济大学校长；陈杰：2018.7-2020.02.12任同济大学校长。

截至2020年2月12日，学校官网显，拥有专任教师2803人，其中专业技术职务正高级1156人，中国科学院院士12人（含双聘），中国工程院院士15人（含双聘），第三世界科学院及美国、德国、瑞典等国科学院或工程院外籍院士19人。国家级教学名师5人，教育部“长江计划”特聘教授36人，国家重点基础研究发展计划首席科学家23人，国家重点研发计划首席科学家64人，国家杰出青年科学基金获得者62人，“青年长江”“优秀青年科学基金获得者”等四类优秀青年人才162人。国家级教学团队6个，国家自然科学基金创新群体8个，教育部创新团队9个，科技部重点领域创新团队1个，入选科技部“国家创新人才培养示范基地”。

截至2020年2月12日，学校官网显，学校学科设置涵盖工学、理学、医学、管理学、经济学、哲学、文学、法学、教育学、艺术学等10个门类。现有本科招生专业84个，硕士学位一级学科授权点47个，专业硕士学位授权点24个，博士学位一级学科授权点32个，专业博士学位授权点9个，博士后流动站30个。拥有3个国家重点实验室、1个国家工程实验室、1个国家重大科技基础设施、1个国家协同创新中心、1个国家大型科学仪器中心、5个国家工程（技术）研究中心、5个其他国家级研究平台以及63个省部级研究平台。

截至2020年2月12日，学校官网显示，同济大学设有29个专业学院，8家附属医院，6所附属中小学。有四平路、嘉定、沪西和沪北等4个主要校区，占地面积2.54平方公里，校舍总建筑面积181余万平方米，图书馆总藏书量443万余册。