东南大学、南京大学等高校的四位退休教授于1992年发起并创办三江大学；1993年6月江苏省政府同意三江大学筹建并试招生；1995年4月由原国家教委批准正式建校；1999年学校定址于雨花台区铁心桥；2002年2月经国家教育部批准升格为本科高校，定名为三江学院。2006年5月通过江苏省学士学位授予权评审。2007年5月我校作为全国首家民办本科高校接受了教育部普通高等学校本科教学工作水平评估，2008年3月以良好的成绩通过教育部普通高等学校本科教学工作水平评估。
2011年学校成为江苏省高等教育综合改革实验区、江苏省“建立现代大学制度”项目的试点高校。2017年学校成为江苏省硕士学位研究生授权单位建设点。2018年学校在省编制部门登记为事业单位法人。截至2020年1月18日，学校官网显示，现有专任教师569人，外聘教师525人。任课教师中高级职称教师占52.7%，具有硕士、博士学位的教师占84.4%，“双师双能型”教师占32.7%。享受国务院特殊津贴教师4人、入选省级人才工程项目30人，专业带头人均具有高级职称。“名师引领、骨干支撑、双师结构”的师资特色初步显现。
截至2020年1月18日，学校官网显示，设有13个二级学院、49个本科专业。学校以“强化优势专业，改造传统专业，培育新兴专业”为指导，组建了与江苏省支柱产业和新产业密切对接的六个专业集群，形成了工、文、管、经、法、艺、理等协调发展的专业布局。目前拥有国家级综合改革试点专业 1 个、江苏省级品牌专业2个、省级卓越工程师试点专业1个，省级及以上重点建设专业数量和层次均名列全省民办本科高校首位。
截至2020年1月18日，学校官网显示，学校现有铁心桥主校区、东校区、南校区、东山校区、竹山路校区。五校区占地面积共1030.4亩，建筑面积47.47万㎡，教学行政用房约20.75万㎡，学生宿舍面积14.37万㎡。千兆光纤校园网覆盖整个校园，图书馆藏书344.66万册。