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历史沿革：首都医科大学原名北京第二医学院，创建于1960年9月12日。1985年8月22日更名为首都医学院。1986年8月27日,确定首医为市属重点院校。1994年2月5日经教育部批准，更名为首都医科大学。2000年9月12日，首都医科大学创院40周年。2010年9月12日，首都医科大学创院50周年。2010年，入选国家“特色重点学科项目”建设高校。 2011年底，入选国家建设高水平大学公派研究生项目。 2012年11月，入选教育部、原卫生部首批卓越医生教育培养计划项目试点高校。 2015年4月，入选教育部、国家中医药管理局卓越医生（中医）教育培养计划改革试点高校。12月，北京市人民政府、国家卫生计生委、教育部决定共建首都医科大学。 2017年3月，入选北京市 “一带一路”国家人才培养基地项目。 2018年4月13日，成为京港大学联盟创始成员。 2019年9月，入选省部共建协同创新中心。12月，首都医科大学等6所医学院校发起成立北京卓越医学人才培养高校联盟。 2019年12月，中国医学科学院在北京发布了《2018年度中国医学院校科技量值报告》，首都医科大学综合排名位列前10位。

历任校长：
陈应谦：1980.8至1984.4；
李光弼1984.4至1985.10；
徐群渊：1985.10-1994.6任首都医学院院长；
徐群渊：1994.6-2002.3；
杜金香：2002.3至2004.11；
吕兆丰：2004.11至现今任首都医科大学校长。

截至2020年1月6日，学校官网显示，有全日制在校生12422人，其中研究生4648人，本科生5309人，高专高职生1765人，留学生700人；成教生3121人。学校和附属医院现有教职员工和医务人员42791人（校本部1470人，附属医院41321人），其中有中国科学院院士3人、中国工程院院士4人；正高职称2596人，副高职称4164人；教授944人，副教授1303人；博士生导师689人，硕士生导师1124人；有7个国家级优秀教学团队，1个黄大年式教师团队，11个市级优秀教学团队，1名国家级教学名师、24名市级教学名师、1名青年教学名师、3名“高创计划”教学名师。

截至2020年1月6日，学校官网显示，学校校本部设有10个学院、1个学部、1个研究中心、1所附属卫生学校；32个临床诊疗中心；开办24个本科专业、14个专科专业；有21所临床医学院（其中19所为附属医院）；还设有38个临床专科学院、专科学系。

截至2020年1月6日，学校有教育部、国家卫生健康委员会“卓越医生教育培养计划”试点项目6个；7个国家级和10个市级特色专业、2个北京市一流专业；7门国家级和18门市级精品课程、5门国家级精品资源共享课程、1门国家级精品视频公开课；3个国家级和6个市级实验教学示范中心、3个国家级人才培养模式创新实验区和1个市级人才培养模式创新试验区、1个国家级大学生校外实践教育基地、5个北京市级校外人才培养基地和1个素质教育基地；建有国家生命科学与技术人才培养基地、原卫生部全科医学培训中心、北京市全科医学培训中心、首都卫生管理与政策研究基地等。2014年，学校通过了教育部临床医学专业认证。