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1958年，中山医学院湛江分院成立。
1964年，升格为五年制医学本科院校并更名为湛江医学院。
1986年，获硕士学位授予权单位，是广东省属重点建设大学。学校是全国首批获学士学位授予权单位。
1991年，获广东省办学水平评估一等奖。
1992年，学校易名为广东医学院。 1996年9月，学校与日本大阪高技术学院、大阪医疗技术学院合作办学。 2002年10月，广东省教育厅批准广东医科大学创办东莞校区；同年11月，学校成立筹建东莞校区工作领导小组，并设立筹备建设办公室；12月12日，东莞校区奠基。 2003年2月，东莞校区破土动工，同年10月23日，东莞校区首批新生顺利入学。 2009年，学校被广东省列为国家限额指标内的拟新增博士学位授予单位立项建设单位。 2013年，学校获批为博士学位授予单位。 2015年6月，学校申报更名为“广东医科大学”。 2016年3月22日，教育部正式发函批准广东医学院更名为广东医科大学。

项凡：1983.06-1987.10任广东医学院院长；梁念慈：1987.10-2002.03任广东医学院院长；罗少军：2002.03-2006.03任广东医学院院长；周克元：2006.03-2012.06任广东医学院院长；郑学宝：2012.6-2016.05任广东医学院院长；卢景辉：2016.07.17-2020.1.31任广东医科大学校长。

截至2020年1月31日，学校官网显，学校现有教职工1800多人，其中专任教师1314人，博士生导师49人，硕士生导师801人，双聘院士1人，广东省青年珠江学者2人，广东省自然科学杰出青年基金获得者1人。学校有国务院政府特殊津贴专家15人，全国模范教师、全国优秀教师、全国高校优秀辅导员等8人，广东省教学名师5人，“千百十人才培养工程”省级培养对象14人，省“特支计划”人才2人，“扬帆计划”32人，南粤杰出教师、南粤教坛新秀、南粤教书育人优秀教师、南粤优秀教师和南粤优秀教育工作者60人次，广东省优秀中医临床人才和名中医5人，广东省优秀青年教师培养对象17人。

截至2020年1月31日，学校官网显示，学校形成了较为合理的学科专业结构，现有博士学位授权一级学科1个，硕士学位授权一级学科6个，硕士专业学位授权点3个。有省级重点学科7个（省级攀峰重点学科1个、省级优势重点学科2个、省级特色重点学科4个），珠江学者岗位计划设岗学科5个。设有普通本科专业30个，覆盖医学、理学、管理学、法学、工学、文学、经济学等7个学科门类，面向全国26省和港澳台地区招生。

截至2020年1月31日，学校官网显示，学校总面积近1900亩，由湛江校区、东莞校区两部分组成，湛江校区位于富有亚热带风情的沿海开放城市湛江市；东莞校区创建于2002年，位于东莞市美丽的松山湖科技产业园区。