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昭通学院历史可追溯到1906年 清政府创设的师范传习所，历经省立第二师范学校、昭通地区师范学校，1978年成立昭通师范专科学校，是“文革”结束后全国首批确定，云南省州、市建校较早的高校之一。 1993年，学校定名为昭通师范高等专科学校，简称昭通师专。 2000年8月，经云南省人民政府批准，昭通师范高等专科学校与昭通师范学校（原昭通教育学院和昭通地区师范学校）合并，组建新的昭通师范高等专科学校。 2012年3月，经教育部批准，学校升格为本科院校，定名为昭通学院。 2013年6月28日，昭通学院正式揭牌成立，成为昭通市第一所本科层次的普通高校 。

历任校长：
彭文虎：1988.8-2000.12任昭通师范高等专科学校校长；陈孝宁：2001年8-2007.3任昭通师范高等专科学校校长；陈季林：2007.3-2012.8任昭通师范高等专科学校校长；马丽娟：2012.8-2018.9任昭通学院院长；周学斌：2018.9-2019.9任昭通学院院长；陈 红：2019.9-2020.02.08任昭通学院院长。

截至2020年2月8日，学校官网显，学校现有教职工710人。其中，高级职称291人，具有博士和硕士学位的373人。多名教师承担着博士研究生和硕士研究生的指导工作。学校历来重视师资队伍建设，通过大力引进高层次人才，积极支持在职教师到国内外重点大学访学和进修学习，实施教学名师支持计划、优秀青年教师培养支持计划等工程，学校师资队伍不断增强，拥有“全国会计名家”“教育部工商管理教学指导委员会委员”“财政部会计教育专家委员会委员”“云南省工商管理教学指导委员会主任委员”、云南省“万人计划”“云岭教学名师”“省级教学名师”“乌蒙工匠”等全国和全省知名的专家学者。

截至2020年2月8日，学校官网显示，学校目前设有人文学院、农学与生命科学学院、政治与管理学院、教育科学学院、物理与信息工程学院等13个教学学院和1个大学生创新创业园（创新创业学院），38个本科专业，22个专科专业，面向全国十多个省、市招生。

截至2020年2月8日，学校官网显示，学校建有实验实训教学中心5个，拥有专业实验室68间，实验实训基地149个，公共教学设施平台中省级实验实习实训基地与技术创新服务中心2个，5星级国际学术会议中心1个。