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学校前身为新疆八一农学院，由王震将军在原中国人民解放军第二步兵学校的基础上于1952年8月1日创建的，1995年4月21日，经原国家教委批准，更名为新疆农业大学。 2006年，教育部本科教学工作水平评估优秀。同年，入选国家大学生文化素质教育基地。 2010年，入选国家“特色重点学科项目”建设高校。 2011年底，入选国家建设高水平大学公派研究生项目。2012年，入选国家“中西部高校基础能力建设工程”高校。 2013年，入选教育部“卓越工程师教育培养计划”高校。 2014年5月，成为国家林业局与自治区人民政府共建高校。9月，入选国家首批“卓越农林人才教育培养计划”改革试点高校。

新疆农业大学历任校长：
雒秋江：1999.9-2017.04.01任新疆农业大学校长；蒋平安：2017.04.01-2020.02.18任新疆农业大学校长。
许 鹏：（1987至1991.6任新疆八一农学院院长）；
尹经章：（1991.6至1999.9新疆八一农学院院长，任新疆农业大学校长）。
学校领导：
委书记、副校长：李宝城
党委副书记、校长：雒秋江
党委副书记：张杰、再娜甫·尼合买提
副校长：赵吉远、阿不来提·阿不都热依木、苏来曼·亚森、高发水、王长新、蒋平安、叶民、塔义尔·肉孜
纪检委书记：刘卫

截至2020年2月18日，学校官网显，　建校以来，学校始终坚持社会主义办学方向，贯彻落实“立德树人”根本任务，始终传承“红色基因”，秉承“自力更生、艰苦奋斗”的“南泥湾”精神，始终坚持“屯垦戍边办大学、稳疆兴疆育人才”的办学宗旨，始终坚持“理论联系实际、教学结合生产”的办学方针，形成了本、硕、博完整的人才培养体系。学校现有7个博士后流动站，8个一级学科博士学位授权点，17个一级学科硕士学位授权点，14个硕士专业学位授权点，59个本科专业，分布在农、理、工、经、管、文、法等7个学科门类中。有20个学院，1个教学部，在编教职工1776人，全日制在校生24649人。

截至2020年2月18日，学校官网显示，学校先后与美国、加拿大、俄罗斯、巴基斯坦等二十多个国家和地区的七十余所大学及研究机构建立合作关系。在巴基斯坦建成的孔子学院成为全球100所示范孔子学院之一。成立“新疆-中亚现代农业科技创新与交流中心”等国际合作平台。与中国农业大学等兄弟院校共同发起成立“丝绸之路沿线国家农业院校联盟”，有力推动了丝绸之路经济带沿线国家农业院校高等教育的共同发展。

截至2020年2月18日，学校官网显，学校本部占地面积约1500亩，校园绿草如茵，铺青叠翠，环境优美，是自治区首批绿色大学，自治区文明单位。此外学校拥有南山实习林场、三坪实践教学基地暨现代农业科技示范园区等7个校外实习基地。