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齐齐哈尔医学院是黑龙江省西北部地区唯一一所高等医学院校。组建以来，经历了曲折的发展历程。1947年初，黑龙江军区卫生部将黑龙江军区军医学校更名为黑龙江军区卫生学校。1948年秋，黑龙江军区卫生部随军南下，黑龙江军区卫生学校移交给地方政府，建立了黑龙江省卫生学校，隶属黑龙江省政府民政厅卫生处领导。951年1月，全国中等技术教育整顿会议后，黑龙江省立卫生干部学校改建为黑龙江省医士学校，隶属黑龙江省卫生厅和文教厅，并列为东北人民政府所属中等卫生学校的实验学校。1995年国家教委决定对学院进行教学工作合格评价，1996年8月学院搬迁至原东北重型机械学院校址，1997年11月顺利通过国家教委的合格评价。2000年以来，经省政府批准，齐齐哈尔铁路中心医院和哈尔滨铁路局齐齐哈尔专科医院成为学院直接领导的第三、第四附属医院，大庆龙南医院、齐齐哈尔市第一医院成为学院非直接领导的第五、第六附属医院。学院已经发展成为黑龙江省西北部地区医学教育、医学科研和医疗服务中心。2008年4月，学院整体从富拉尔基区搬迁到建华区卜奎北大街333号，有利于学院未来的大跨越式发展。

韩一眉：1993.9-2004.7任齐齐哈尔医学院院长；刘吉成：2004.7-2017.2任齐齐哈尔医学院院长；顾长虹：2017.2-2018.9任齐齐哈尔医学院院长；赵炜明：2018.9-2020.1.22任齐齐哈尔医学院院长。

截至2020年1月22日，学校官网显示，现有教职工5752人，其中副高职以上人员1115人。学院本部专任教师中副高职以上人员385人，占专任教师总量的53.6%。学院本部专任教师中具有博士、硕士学位人员615人，占专任教师总量的85.7%。现有普教、成教、留学生等各类在校生14186人。

截至2020年1月22日，学校官网显示，学院设有24个教学及教辅机构，设有本科专业24个，涵盖了医学、理学、工学、管理学、法学等5个学科门类。其中，精神医学专业为国家一类特色专业，临床医学、精神医学、药学、预防医学等4个专业为省级重点专业。拥有6门省级精品课程、2个省级实验教学示范中心、2个省级教学团队、1个省级人才培养创新实验区、1个省级教育科学A类研究团队。学院先后通过了教育部临床医学专业认证、教育部护理学专业认证、教育部本科教学工作审核评估。

截至2020年1月22日，学校官网显示，学院校园规划占地面积约110万平方米，建筑面积27万平方米。固定资产总值10.8亿元，教学科研仪器设备总值2.65亿元。学院有11所附属医院（其中4所直属附属医院）和临床病理诊断中心，拥有27所教学医院、90所实习基地，附属医院开放床位15262张，能够很好地满足临床教学和生产实习需要。