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佳木斯医学院院长邱洪斌：2012.01-任佳木斯大学校长；孟祥才：2008.1-2012.1任佳木斯大学校长；张少杰：2001.1-2007任佳木斯大学校长；吕学诜：1996.11-2001.1任佳木斯大学校长。

佳木斯医学院前身是1947年成立的合江军区卫生干部学校。在1995年6月27日，经原国家教委批准由佳木斯医学院、佳木斯工学院、佳木斯师范专科学校和原佳木斯大学四所学校合并组成佳木斯大学。佳木斯大学坐落于佳木斯。佳木斯大学是黑龙江省东部地区规模最大、综合实力最强的大学。佳木斯大学始建于1947年，经过60多年的发展建设，已经成为融研究生教育、普通高等教育、继续教育和留学生教育于一体的黑龙江省属重点综合性高水平大学之一。在2013年底，有80个本科专业，34硕士学位授权学科，3个博士学位授权学科，拥有“两院”院士、长江学者、龙江学者等一批特聘教授和客座教授。1950年5月，原合江省立卫生干部学校也更名为松江省卫生学校，松江省立第二医院为学校的实习医院。 1951年7月19日，松江省人民政府卫生厅决定，将原松江省卫生干部学校改为松江省医士学校，原松江省省立第二医院改为松江省医士学校附属医院。 1954年10月30日，继松江省合并为黑龙江省之后，经黑龙江省人民政府批准，将松江省医士学校更名为黑龙江省医士学院。 1958年夏，黑龙江省医士学校扩建为佳木斯医学院，原中专部分暂时保留。建立学院后，马品洁担任党委副书记兼副院长。学院设院长办公室、教务科、总务科、基础医学部、医疗系；党委设党委办公室、宣传部、组织部等机构；基础医学部设有教研室12个。王德育为基础医学部第一任主任。 1972年，学院恢复正式招生。 1980年，学院在招生本科生的同时与外校联合培养硕士研究生。 1982年，国务院学位委员会批准佳木斯医学院为学士学位授权院校。 1986年，学院获硕士学位授予权。第一批获得硕士学位授予权的学科是：病理生理学、人体解剖学和儿科学。同年10月5日，8名研究生顺利通过了病理生理学、人体解剖学、儿科学三个学科论文的论文答辩。11月8日，学院隆重举行1986届研究生毕业暨首次颁发硕士学位证书典礼。 1990年，生物化学、免疫学和遗传学3个学科获批硕士学位授予权学科。 1993年，生药学、口腔科学、外科学(胸心外科)等3个学科获批硕士学位授予权学科。 1995年6月27日，经原国家教委批准，佳木斯医学院与佳木斯工学院、佳木斯师范专科学院、原佳木斯大学合并为佳木斯大学，佳木斯医学院更名为佳木斯大学医学院相对独立运行，原学院佳木斯医学院基础医学部既成为佳木斯大学医学院基础医学院部。

截至2020年1月22日，学校官网显示，佳木斯大学有教职工4839人，其中高级职称1637人，省优秀教学团队2个，硕士研究生导师522人。拥有“两院”院士、长江学者、龙江学者等一批特聘教授和客座教授；拥有林尚扬、钟世镇、孙传尧、李兰娟、蒋亦元等5名共享院士；拥有在国内同领域中享有盛名的“中国小儿脑瘫康复之父”李树春教授、遗传学专家吕学诜教授、微生态学专家杨景云教授、昆虫学专家张雨奇教授；拥有龙江学者张二林教授、李慕勤教授；拥有全国模范教师罗佳滨教授，省级教学名师李晓捷教授、张凤杰教授、王淑秋教授等一批在省内乃至国内颇具影响力的中青年专家。