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福建中医药大学是福建省重点建设高校，前身是创建于1958年的福建中医学院，2010年2月3日，经教育部审核后，福建中医学院升格为福建中医药大学。是我国创办较早的高等中医药院校之一。学校有11个国家中医药管理局重点学科，12个省级重点学科。2003年以来，作为福建省重点建设高校之一，学校以学科建设为核心，带动其它相关内涵建设的发展，取得显著成绩。2008年，学校再次被列入福建省重点建设高校。学校是内地第一所招收台湾学生的中医药院校.学校1998年、2000年、2002年、2006年、2009年五次被福建省委、福建省人民政府授予“文明校园”荣誉称号。2002年12月，学校在教育部组织的第一轮本科教学水平评估中获得“优秀”成绩。2003年成为福建省人民政府重点建设的8所高校之一。2008年，学校再次被列入福建省重点建设高校。 2010年3月18日，教育部印发《关于同意福建中医学院更名为福建中医药大学的通知》，学校正式更名为福建中医药大学。 2013年1月，入选国家级大学生创新创业训练计划项目。 2015年4月，福建中医药大学入选国家“卓越医生（中医）教育培养计划”改革试点高校。 2016年，学校顺利通过本科教学工作审核评估，康复物理治疗（PT）和作业治疗（OT）分别通过世界物理治疗联盟（WCPT）、世界作业治疗联盟（WFOT）国际教育标准认证。 2018年，入选福建省一流学科建设高校行列，其中中西医结合、中医学入选福建省A类高峰学科，中药学、护理学、药学入选福建省高原学科，临床医学、管理学入选福建省应用型学科。 2019年7月，学校入选福建省一流大学建设高校。

俞长荣：1983.11-1987.1任福建中医学院院长；杜建：1987.1-2008.5任福建中医学院院长； 陈立典：2008.5-2010.3任福建中医学院院长；陈立典：2010.6-2017.10.18任福建中医药大学校长；李灿东：2017.10.18-2020.1.28任福建中医药大学校长。

截至2020年1月29日，学校官网显示，学校有教职医护员工（含四所直属附属医院）3000多人，其中具有高级职称的专业技术人员500多人；拥有一批国家和卫生部有突出贡献的中青年专家、国务院特殊津贴专家、国家级名老中医学术继承人指导老师、全国百名杰出青年中医、全国优秀教师等，其中国家级教学团队2个，省级教学团队7个

截至2020年1月29日，学校官网显示，学校设有13个学院（部），开办19个本科专业（不包括专业方向）。学校拥有3门国家级精品课程、4个国家级特色专业、1门国家级双语教学示范课程、1个国家级人才培养模式创新实验区、2门国家级精品视频公开课、3门国家级精品资源共享课、1个国家级专业综合改革试点、2项国家级卓越医生（中医）教育培养计划改革试点项目、5个省级实验教学示范中心、1个国家级大学生校外实践教育基地和92项国家级大学生创新创业训练计划项目；在近两届教学成果评选中获国家级二等奖1项，省级特等奖3项、一等奖5项、二等奖9项。

截至2020年1月29日，学校官网显示，学校拥有两个校区，共占地1030亩，各类建筑总面积32万多平方米，教学科研仪器设备总值3.8亿多元，纸质图书129万册、电子图书88万册；