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中国科学技术大学于1958年国家利用中国科学院自身优势创办一所培养新兴、边缘、交叉学科尖端科技人才的新型大学，创建于北京，首任校长为当时的中国科学院院长郭沫若。 在文化大革命的严重冲击下，科大于1969年12月被迫搬出北京。1978年3月开设了少年班，首期少年班共招收21名少年大学生。1980年，科大帮助建立了合肥联合大学，副校长杨承宗兼任合肥联合大学校长，1999年12月，合肥经济技术学院并入中国科学技术大学。2008年是中国科大建校第五十年，中国邮政集团同日发行中国科大建校五十周年纪念邮票。2014年1月7日揭牌成立中国科学技术大学研究生院科学岛分院。 2015年起，成立中国科学技术大学材料科学与工程学院。 2016年成立中国科学技术大学天文与空间科学学院；中国科学院苏州纳米技术与纳米仿生研究所教育归口单位变更为中国科大，成立中国科学技术大学纳米技术与纳米仿生学院。 2017年起，中国科学院长春应用化学研究所教育归口单位变更为中国科大，成立中国科学技术大学应用化学与工程学院。 2017年9月，入选国家首批“双一流”世界一流大学A类建设高校； 2018年11月，中国科大与中国银行在京签署战略合作协议。12月，中国科学技术大学党委被教育部列为首批“全国党建工作示范高校”培育创建单位。 [28-33] 2019年5月22日，中国科学技术大学等“华东五校”在芜湖共同发起成立长三角研究型大学联盟。7月，发起成立中国高校行星科学联盟。12月，发起成立长三角医学教育联盟。

历任校长
严济慈：1980.2-1984.9；管惟炎：1985.4-1987.1；滕藤：1987.1-1988.2；谷超豪：1988.2-1993.7；汤洪高：1993.7-1998.6；朱清时：1998.6-2008.9；侯建国：2008.9-现今
党委书记
严济慈：1980.2-1984.9任中国科学技术大学校长；管惟炎：1985.4-1987.1；滕藤：1987.1-1988.2；谷超豪：1988.2-1993.7任中国科学技术大学校长；汤洪高：1993.7-1998.6；朱清时：1998.6-2008.9；侯建国：2008.9-2015.1任中国科学技术大学校长；万立骏：2015.03-2017.06；包信和：2017.7-2020.1.20任中国科学技术大学校长。

截至2020年1月20日，学校官网显示，学校共有教学与科研人员2154人，其中教授701人（含相当专业技术职务人员），副教授800人（含相当专业技术职务人员）。中国科学院和中国工程院院士55人，发展中国家科学院院士17人，国家万人计划领军人才30人，青年拔尖人才13人，国家杰出青年科学基金获得者115人，优秀青年科学基金获得者108人，教育部长江学者（含青年）51人，国家级教学名师7人。

截至2020年1月20日，学校官网显示，学校现有23个学院（含6个科教融合共建学院）、33个系，设有研究生院、生命科学与医学部、信息与智能学部，以及苏州研究院、上海研究院、北京研究院、先进技术研究院、中国科学技术大学附属第一医院（安徽省立医院）等。现有28个一级学科博士学位授权点，7个一级学科硕士学位授权点，15个专业学位授权点，有数学、物理学、力学、天文学、生物科学、化学共6个国家理科基础科学研究和教学人才培养基地和1个国家生命科学与技术人才培养基地，数学、物理学、化学、天文学、地球物理学。

截至2020年1月20日，学校官网显示，学校面向世界科学前沿领域和国家重大需求，凝练科学目标，开展科学研究，努力提高学术研究水平和科研创新能力与科研竞争力，取得了一批具有世界领先水平的原创性科技成果。在新的历史起点上，学校加快建设具有中国特色、科大风格的世界一流大学，在国家“双一流”建设中，入选A类世界一流大学建设高校。