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原曲靖卫生学校始建于1958年，曲靖医学高等专科学校于1958年建校， 2006年2月经教育部批准独立设置升格为医学高等专科学校，至今已有60年办学历史。 2010年，学校以优异成绩顺利通过国家高等职业院校人才培养评估工作，先后被确定为国际护士执业水平考试项目协作单位、国家“卓越医生教育培养计划”改革试点高职高专院校、国家第二批眼视光专业现代学徒制试点单位、云南省首批特色骨干高等职业院校、云南省“六T”管理合格学校、云南省滇东北医药卫生综合性公共实训基地、云南省高职高专医学类师资培训基地、云南省社会主义核心价值观建设示范高校、“澜沧江-湄公河职业教育联盟”高校、云南省外派人才及劳务输出基地和护理专业认证与评估五星级学校。2018年成功入选“云南省管理水平提升行动计划职业院校管理15强示范校”“云南省职业院校教学管理15强、学生管理15强案例拟推荐院校”。

历任校长：
巴春生：2009.1-2016.11任曲靖医学高等专科学校校长；王明琼：2016.11-2020.1.19任曲靖医学高等专科学校校长。

截至2020年1月19日，学校官网显示，学校有教职员工360余人。2015年，学校经国家教育部批准开始正式与加拿大罗耶斯特学院联合招收康复治疗技术专业学生。2018年经省教育厅批准，学校可以招收留学生，实质性开展了中外合作办学。学校连续6年荣获云南省高校毕业生就业创业工作目标责任考核一等奖，毕业生年终就业率达98％以上。

截至2020年1月19日，学校官网显示，学校有临床学院、护理学院、马克思主义学院、继续教育学院、卫生与健康管理系、医学技术系、药学系、公共课部、基础医学部等9个二级教学部门共开设21个专业，其中临床医学、护理、眼视光技术等7个专业为省级高水平骨干专业。学校面向13个省、市、自治区招生，现有全日制在校生8400余人，继续教育学生9000余人，

截至2020年1月19日，学校官网显示，学校设有两个教学区，总占地面积367亩，建筑面积11.14万平方米。目前，占地1500多亩的马龙新校区正在建设中。