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新疆工学院历任院长：孙德水：1983.10-1990.12任新疆工学院院长；吉汗·哈克莫夫：1991.1-1998.3任新疆工学院院长；安尼瓦尔·阿木提 ：1998.3-2000.12任新疆工学院院长；塔西甫拉提.特依拜：2010.12-2017.03.31任新疆大学校长；许咸宜：2017.03.31-2020.02.18任新疆大学党委书记主持工作。

新疆工学院前身是1953年1月成立的中苏有色金属公司矿山技术学校。 1955年1月更名为重工业部乌鲁木齐矿业学校。 1956年9月易名为冶金工业部乌鲁木齐矿业学校。 1958年7月改名为新疆矿冶学院。 1962年7月新疆大学机械、电机、工电等3个工科专业并入新疆矿冶学院。 1966年5月更名为新疆工学院。2000年10月20日，教育部批准了新疆大学和新疆工学院合并组建新的新疆大学。

新疆工学院与新疆大学于2000年12月30日合并组建新的新疆大学，新疆大学位于新疆维吾尔自治区首府乌鲁木齐市，是目前新疆办学规模最大、办学历史最悠久、学科门类最齐全、科研水平最高的综合性大学，是新疆唯一一所全国重点大学，是国家面向21世纪重点建设的“211工程”百所大学之一，是教育部与自治区“区部共建”高校。新疆大学现有23个学院，1个研究生院，1个独立学院，1个教学研究部，4个教学实践中心，8个研究所，1个干旱半干旱可持续发展国际研究中心。学校现有哲学、经济学、法学、文学、历史学、理学、工学、管理学八个学科门类，涵盖了高级专门人才培养和科学研究的主要领域。现有80个本科专业，10个国家特色专业，19个自治区紧缺人才专业；8个博士学位授权一级学科、47个博士学位授权二级学科，9个博士后科研流动站，29个硕士学位授权一级学科、153个硕士学位授权二级学科，8个专业硕士学位点；2个国家级重点学科，1个国家重点（培育）学科；6个“211工程”重点建设学科群、16个自治区级重点学科、2个自治区重点（培育）学科。