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西北农林科技大学肇始于1934年成立的国立西北农林专科学校（后成为西北农业大学），为校史之源。
1934年，成立西北林学院，前身是原西北农学院森林系，1979年从西北农学院分出，成立西北林学院。由林业部与陕西省双重领导，以林业部为主。
1938 年7 月, 奉教育部令, 与国立西北联合大学农学院、河南大学农学院畜牧系合并，成立国立西北农学院。国立西北农学院解放后更名为西北农学院。
1985年经原农牧渔业部批准，学校更名为西北农业大学。
1999年9月11日，由共处陕西杨凌的原西北农业大学、 西北林学院、 中国科学院水利部水土保持研究所、水利部西北水利科学研究所、陕西省农业科学院、陕西省林业科学院、陕西省中国科学院西北植物研究所等7个教学、科研单位合并组建为西北农林科技大学。
2003年8月，教育部批准学校试办研究生院。 2004年6月，进入国家"985工程"建设序列。 2007年6月，教育部正式批准学校建立研究生院，校长孙其信教授兼任研究生院院长。9月，首批入选国家大学生创新性实验计划实施高校。 2009年，教育部和农业部共建西北农林科技大学。 2010年，教育部和国家林业局共建西北农林科技大学。 2012年9月，首批入选国家级大学生创新创业训练计划实施高校。 2017年9月，西北农林科技大学入选国家“双一流”（世界一流大学和一流学科）建设高校。

刘于鹤：1983.12-1986.7任西北林学院院长；王性炎：1986.7-1991.12任西北林学院院长；李广毅：1991.12-1997.11任西北林学院院长；陈存根：1997.11-1999.9 任西北林学院院长；张 岳：1985.10-1991.11任西北农业大学校长；荆家海：1991.11-1996.1任西北农业大学校长；张宝文：1996.1-1999.1任西北农业大学校长；陈宗兴：1999.9-2003.8任西北农林科技大学校长；孙武学：2003.8-2011.1任西北农林科技大学校长；孙其信：2011.1-2017.7.19任西北农林科技大学校长；吴普特：2017.12.27-2020.1.27任西北农林科技大学校长.

截至2020年1月27日，学校官网显示，学校现有教职工4535人，其中专任教师2236人，正高级专业技术人员619人，副高级专业技术人员1310人。 有中国科学院院士1人，中国工程院院士2人，双聘院士11人；国家“人才项目专家”入选者7人，青年人才项目专家入选者13人；“长江学者”特聘教授6人，青年长江学者3人；“万人计划”科技创新领军人才6人，青年拔尖人才3人；国家杰出青年科学基金获得者8人，优秀青年基金获得者8人；国家百千万人才工程入选者12人，新世纪优秀人才支持计划入选者64人；陕西省“百人计划”入选者43人，学校“特聘教授”12人，国家教学名师2人。

截至2020年1月27日，学校官网显示，设有26个学院（系、所、部）和研究生院，共有13个博士后流动站，16个博士学位授权一级学科，27个硕士学位授权一级学科，67个本科专业。现有7个国家重点学科和2个国家重点（培育）学科；农业科学居US.NEWS学科排名全球第30位；农业科学学科领域进入ESI全球学科排名前1‰之列，农业科学、植物学与动物学、工程学、环境科学与生态学、化学、生物学与生物化学、药理学与毒理学、分子生物学与遗传学8个学科进入ESI前1%。建有2个国家重点实验室，1个国家工程实验室，3个国家工程技术研究中心，3个国家野外科学观测研究站，66个省部重点实验室及工程技术研究中心。

截至2020年1月27日，学校官网显示，合校以来，累计获得国家级科技奖励42项，其中主持完成14项；主持完成省部级科技成果一等奖79项；获陕西省科技进步最高成就奖1项。获国家授权发明专利1421件；审定动植物新品种547个。发表SCI、EI、SSCI论文21627篇，其中2018年第一署名单位SCI、EI、SSCI论文2814篇。现有8家农、林、水专业陕西省一级学会挂靠学校，编辑出版20种学术期刊，建有大学出版社。