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1976年，商洛学院前身“陕西师范大学商洛专修科”成立。
1984年，经陕西省人民政府批准更名为“商洛师范专科学校”。
2005年5月，商洛农业学校整体划转并入“商洛师范专科学校”。
2006年2月，经教育部批准升格为本科院校，是一所地方特色鲜明、多学科协调发展的教学型本科院校，截至2006年商洛学院为国家培养了1.6万多名本专科人才。
2011年7月5日，陕西省教育厅和商洛市人民政府举行省市共建商洛学院协议签字仪式，这标志着商洛学院成为陕西省第三所省市共建地方本科院校。
2013年，商洛学院全日制在校生将首次突破万人大关，达到10700人，提前两年实现“十二五”规划预定的万人办学规模。

历任党委书记：
张兴华：1992-1998.12任商洛师范专科学校校长；张景书：2005..06-2008.6任商洛师范专科学校校长；2008.6-2013.7任商洛学院院长；刘建林：2013.6-2016.9任商洛学院院长；范新会：2017.03任商洛学院校长。

截至2020年1月12日，学校官网显示，现有教职工723人，其中具有硕士以上学位教师518人（博士119人），具有高级职称教师254人，聘请中国科学院赵鹏大院士、中国工程院张生勇院士为“双聘院士”，有二级教授3人、三级教授3人，国家级师德标兵1人、陕西省师德标兵3人，陕西省教学名师6人，陕西省“百人计划”1人、“特支计划”1人、“青年杰出人才”4人，“三秦人才津贴”获得者3人。

截至2020年1月12日，学校官网显示，现有省级“一流专业”4个（应用化学、生物技术、计算机科学与技术、汉语言文学）、省级创新创业教育改革试点学院2个（化学工程与现代材料学院、生物医药与食品工程学院）、省级大学生校外创新创业教育实践基地1个、实习实训基地173个，是陕西省“实践育人创新创业基地”。

截至2020年1月12日，学校官网显示，共获批国家自然科学基金项目9项、国家科技推广项目1项，省部级重大、攻关项目16项，获省级以上科研成果奖5项、市厅级各类科技奖励247项，取得知识产权类成果402项。教师发表的学术论文被国际权威检索机构SCI、EI、ISTP等收录308篇，出版各类著作73部，《商洛学院学报》被评为“全国高等学校优秀社科学报”“陕西省高等学校优秀社科学报”和“陕西高校精品期刊”。