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历史沿革：
1958年，创建山东中医学院；
1981年被山东省政府列为省属重点院校，被国务院学位委员会批准为全国高等中医药院校首批学士和硕士学位授予单位。
1986年获得博士学位授予权。
1996年经原国家教委批准更名为山东中医药大学。
1998年设立首个博士后科研流动站，同年被国务院学位委员会批准为首批临床专业硕士学位授予试点单位。
2000年被批准为临床专业博士学位授予试点单位。
2012年，学校成为山东特色名校工程首批5所应用基础型特色名校之一
学院概述：
山东省唯一一所独立设置的医药科大学，2007年学校由济南市历下区主体迁入扁鹊故里-;-;长清，总占地1829亩，建筑面积54.5万平方米，仪器设备总值17087.6万元，馆藏纸质图书110万册、电子图书47万册，有配置完善的计算机校园网和现代教育技术设施。学校设13个二级学院，有3所直属附属医院和11所非直属附属医院、25所教学医院、50余处临床教学基地。

历任校(院)长：
邹积隆：1992-1997.6任山东中医学院院长；王新陆:1997.9-2010.1任山东中医药大学校长；欧阳兵：2010.1-2014.12.25任山东中医药大学校长；武继彪：2015.5-2019.1任山东中医药大学校长；高树中：2019.6-2020.1.14任山东中医药大学校长。

截至2020年1月14日，学校官网显示，现有教职医护员工3400余人，其中博士生导师174人，硕士生导师683人。荣获国家“国医大师”荣誉称号者3人，“全国名中医”3人，“岐黄学者”3人，“973”项目首席科学家1人，全国优秀教师8人，中医药高等学校教学名师2人，山东省教学名师10人，山东省优秀教师6人，山东省“泰山学者”特聘专家10人，山东省“泰山学者”攀登计划专家1人，省部级有突出贡献的中青年专家26人，享受国务院特殊津贴专家52人，山东省名中医药专家96人，“山东名老中医”6人。有山东省优秀教学团队6个，山东省十大优秀创新团队1个，“全国高校黄大年式教师团队”1个。荣获省级以上教学成果奖58项。

截至2020年1月14日，学校官网显示， 拥有28个本科专业，涉及医、理、文、工、管、法、教育等学科门类；有中医学、中药学、中西医结合3个博士学位授权一级学科、15个二级学科，9个硕士学位授权一级学科、46个硕士二级学科；拥有中医博士专业学位授予权和中医、中药学、药学、生物医学工程、护理学硕士专业学位授予权。截至目前，学校全日制在校生21000余人，其中研究生3000余人。学校与40余所国外知名大学、医疗机构建立了长期友好合作关系。

截至2020年1月14日，学校官网显示，现有中医基础理论、中医医史文献、中医内科学3个国家重点学科，中医学、中药学2个山东省一流学科，国家中医药管理局重点学科29个；国家临床重点专科13个，国家中医药管理局重点专科21个；有中医学、中药学、针灸推拿学和制药工程4个国家级特色专业，11个省级特色专业；拥有2个山东省高水平应用型重点建设专业群、3个重点培育专业群；3个专业（群）获山东省教育服务新旧动能转换专业对接产业项目立项。建成10门在线开放课程上线运行。