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宁夏医科大学前身是1958年建立的宁夏医学院。1962年改称宁夏大学医学系。1972年，上海铁道医学院搬迁至银川，与宁夏大学医学系合并重建宁夏医学院。2002年，宁夏卫生学校、宁夏护士学校并入宁夏医学院。2008年8月，学校更名为宁夏医科大学。2010年4月，学校荣获首批“全国50所毕业生就业典型经验高校”荣誉称号。2011年3月，教育部批准将山东大学与学校纳入“对口支援西部地区高等学校计划”，建立“对口支援”合作伙伴关系。2016年，宁夏回族自治区人民政府、国家卫生计生委、教育部联合印发《关于共建宁夏医科大学的意见》，标志着宁夏医科大学成功获批为国家卫生计生委、教育部和自治区政府共建的地方医科大学，正式跻身“省委部共建”高校行列。2014年，宁夏师范学院医学院并入宁夏医科大学，至此，学校成为宁夏唯一的医学高等教育学府。

孙涛：2001.7-2008.8任宁夏医学院院长；孙涛：2008.8-2020.02.20任宁夏医科大学校长；陈树兰：1983.02-1994.06任宁夏医学院院长。

截至2020年2月20日，学校官网显，学校有教职员工及医护人员5600余人（含直属附属医院），其中专任教师905人，副高以上职称723人。有双聘院士1人，博士生导师51人，硕士生导师660人。全日制在校生9293人，其中，博士、硕士研究生1985人，留学生323人。

截至2020年2月20日，学校官网显示，学校有医学、理学和管理学3个学科门类，22个本科专业，其中临床医学、中医学、预防医学、护理学、药学为国家级特色专业，9个为自治区级特色优势专业。有2支国家级教学团队，11支自治区级教学团队。有2个国家级实验教学示范中心，9个自治区实验教学示范中心。

截至2020年2月20日，学校官网显，有雁湖、双怡两个校区，占地面积共1700亩，设有13个教学机构，13个教辅科研机构，有12所附属医院，20所教学医院，70余所实习医院和实践教学基地。